Nat Biotechnol:研究不必重复?可能是HeLa细胞系“变”了

2022-01-31 05:43:30 来源:
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HeLa细胞不会已经在欧美的许多深入研究中都心养成了近70年,并且长期以来被视为是无限供应的不变的完全一致细胞不会。然而,2月初18日发表在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新深入研究表明,细胞不会在各有不同深入研究中都心二者之间假定很大差异性,这引发了对细胞不会系深入研究每一次性的回应。“我很高兴注意到这项深入研究,但在所谓上我并不感到不快,”库珀丹尼尔琳前列腺癌中都心的水分子生物化学家Prasad Jallepalli说是,他没有参与这项深入研究。这并不是HeLa细胞不会系自诞生以来第一次出现多样化的引述:多年来,其他深入研究工作小组也证明了HeLa细胞不会性状基底二者之间在性状序列和RNA表达的各有不同寻常差异性。这项近期深入研究首次全面分析了各种HeLa性状基底的性状性状(各有不同批次的HeLa细胞不会系生活在欧美的各个深入研究中都心),并且首次证明性状异质性导致了蛋白表达和表型的变动。HeLa细胞不会“变了”?在这项深入研究中都,深入研究管理人员从6个东欧国家的13个深入研究中都心收集了14份HeLa样本,并在完全一致的深入研究中都心有条件下同步进行养成。他们首先量化了性状拷贝数性状,揭示了它们真核生物二者之间的各有不同寻常差异性。结果注意到,HeLa性状基底二者之间,特别是CCL2和Kyoto性状基底二者之间假定着非常大的异质性。进一步的推断,许多这些性状差异性转化为mRNA产生的变动,并且在较小高度上转化为蛋白丰度的变动。深入研究管理人员简报说是,HeLa CCL2和Kyoto细胞不会系的转录组和蛋白组谱彼此二者之间的差异性,就像来自两种各有不同类型组织的细胞不会系二者之间的差异性一样。HeLa性状基底在养成过程中都潮湿速率也各有不同,一些细胞不会群集需要17.5星期才能加倍,而另一些细胞不会在完全一致的养成有条件下需要话费最少32星期。它们对沙门氏菌感染者的反应也有所各有不同:与其他两种变基底相比,一种变基底对感染者的敏感性较低,深入研究管理人员将其并不认为低水平的蛋白复合物,这种蛋白复合物在细菌进入肠道细胞不会中都起作用。在一项另行的测试中都,深入研究工作小组通过养成细胞不会系三个月初,来观察HeLa性状基底的性状表达是否不会随着时间发生变动。深入研究管理人员日志了早期细胞不会和晚期细胞不会二者之间性状表达差异性有约6%。伯尔尼联邦理工学院水分子系统工程深入研究机构的Ruedi Aebersell教授是该深入研究的合着者,他说是,“即使在同一个深入研究中都心里,这些细胞不会的差异性和变动速率也是非常惊人的。”他估计,如果一个深入博士生在项目开始时用HeLa细胞不会系做了一个测试,并在六个月初后被要求每一次这个测试,他们才不会赢取各有不同的结果。关于深入研究中都的“可复制性危机”的讨论大多数集中都在测试设计、数据分析方面的缺陷,以及作为主要驱动因素的受污染或贴错标签的细胞不会系。但是Aebersell视为,HeLa细胞不会系和细胞不会系的生物化学差异性可能是更为为重要。为什么不会“变”?哈佛大学的细胞不会生物化学家Tim Stearns视为有几个可能的原因可以理解为什么细胞不会系在短时间养成持续性发生变动。首先,HeLa细胞不会是已知真核生物起伏不定细胞不会,因此很可能随时间随机性状。此外,它们还不会在深入研究中都心中都受到各种潮湿有条件的影响,这才不会促使细胞不会形态出独特的特征。例如,他说是,哺乳动物细胞不会的养成包括将其养成到充满一个养成皿为止,从养成皿中都抽取一部分细胞不会,然后将它们放在另一个养成皿中都潮湿,这一过程称为内部矛盾。“每个人做这件事的作法都有点各有不同,”他说是道。近期这些注意到,对于人类养成细胞不会的深入研究结果的理解和展现性有一定的意义。Aebersell和他的同事在研究成果中都指出了几个具基底的解决方案。首先,深入研究管理人员应该使用细胞不会系的早期传代,并保障在同一细胞不会系的各有不同样本中都每一次同一细胞不会系的测试。更为重要的是,生物化学家应该清楚地简报他们在等价的深入研究中都使用的细胞不会系性状基底。
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